Τον Λεβαδειακό, την Παναχαϊκή και την Κέρκυρα θα αντιμετωπίσει ο Παναθηναϊκός στη φάση των ομίλων του Κυπέλλου Ελλάδος, όπως προέκυψε κατόπιν της κλήρωσης πυο έλαβε χώρα στα γραφεία της ΕΠΟ το μεσημέρι της Πέμπτης (17/9)
Στο πρώτο γκρουπ τέθηκαν επικεφαλής οι 8 πρώτες ομάδες της Super League και ακολούθησαν στο δεύτερο οι υπόλοιπες, συν τους Ηρακλή και Ένωση που προβιβάστηκαν από την Football League. Οι ομάδες που μετέχουν στην δεύτερη κατηγορία χωρίστηκαν, έπειτα από κλήρωση στα δύο τελευταία γκρουπ και προέκυψε η κλήρωση.
Αναλυτικά, οι όμιλοι του Κυπέλλου Ελλάδας:
1ος όμιλος
ΠΑΣ Γιάννινα
Ηρακλής
Αχαρναϊκός
Αναγ. Καρδίτσας
2ος όμιλος
Παναιτωλικός
Πανιώνιος
Εργοτέλης
Ζάκυνθος
3ος όμιλος
ΠΑΟΚ
Πανθρακικός
Χανιά
Ολυμπιακός Βόλου
4ος όμιλος
Παναθηναϊκός
Λεβαδειακός
Παναχαϊκή
Κέρκυρα
5ος όμιλος
Ολυμπιακός
Πλατανιάς
Παναιγιάλειος
Απόλλων Σμύρνης
6ος όμιλος
Ατρόμητος
Βέροια
Λαμία
Καλλιθέα
7ος όμιλος
Skoda Ξάνθη
ΑΕΚ
Λάρισα
Πανελευσινιακός
8ος όμιλος
Αστέρας Τρ.
Καλλονή
Κισσαμικός
Πανσερραϊκός
